Untuk menunjang kegiatan penelitian dosen dan mahasiswa, Departemen Ilmu Komputer memiliki tiga bagian yaitu:
| > | Bagian Sistem dan Jaringan Komputer (Computer Systems and Network, CSN). Bidang Kajian: jaringan komputer, keamanan komputer, kriptografi, robotika, komputasi paralel, sistem terdistribusi, dan komputasi awan. |
| > | Bagian Kecerdasan dan Optimasi Komputasional (Computational Intelligence and Optimization, CIO). Bidang Kajian: pembelajaran mesin, pengenalan pola, pengolahan citra, computer vision, pemrosesan bahasa alami, kecerdasan komputasional, dan sistem pakar. |
| > | Bagian Rekayasa Perangkat Lunak dan Ilmu Informasi (Software Engineering and Information Sciences, SEIS). Bidang Kajian: metrik perangkat lunak, pengujian perangkat lunak, sistem enterprise, usability engineering, e-government, e-commerce, sistem manajemen pengetahuan. |
